Vandens kokybė daro didelę įtaką akvakultūrai. Todėl akvakultūros sektoriui ypač svarbu žinoti aptikimo rodiklius, reguliariai atlikti vandens kokybės patikrinimus ir laiku reaguoti į vandens kokybės rodiklių koregavimą.
Pagrindiniai akvakultūros vandenų tyrimo elementai yra pH, amoniakinis azotas, ištirpęs deguonis, nitritai, sulfidai ir druskingumas. Iš jų ištirpęs deguonis ir tinkamas pH yra esminės sąlygos, o amoniakinis azotas, nitritai ir sulfidai yra pagrindinės toksiškos medžiagos, kurias gamina žuvų ir krevečių metabolizmas. Tikslus ir savalaikis šių medžiagų koncentracijos matavimas ir atitinkamų priemonių ėmimasis gali gerokai pagerinti žuvų ir krevečių išgyvenamumą bei sumažinti veisimo išlaidas.